觀摩演習的民眾聚集在餐廳里聽艦上的軍官講解條例，哪些地方是對民眾開放的，哪些地方是禁止民眾進入的，讓觀摩民眾予以配合。
到了自由活動時間，柯南便讓小男人呆在甲板上別亂跑，他借口上廁所去安放炸彈。
笹浦洋介提供了詳細的資料，在什麼位置安裝炸彈能確保炸沉穗高艦。
一切進行的很順利，柯南回到甲板，帶著小男孩一起去控制室看即將進行的演習。
前來控制室看演習的人很多，誰在誰不在也沒人注意。
等預定的演習結束，柯南就離開了控制室，躲在艦長室外通道盡頭的角落裡。
沒多久，艦長就匆匆離開了艦長室，趕往CIC 控制室。
柯南抓住時機潛進了艦長室，打開了艦長的電腦，在拷貝絕密資料的時候，柯南將一顆定時炸彈裝在了旁邊的柜子里。
很快，外面傳來炮擊的聲音，一枚魚雷從船頭的發射管射出，將佯裝攻擊的船隻掀出了水面。
柯南將戰鬥數據全部拷貝下來，離開了艦長室。
回到CIC 控制室，眾人都在興奮地討論著剛才的演習。
藤井七海和艦長等人卻是皺著眉頭，他們有理由懷疑，這並不是巧合。
這幾天並沒有大風暴，一艘傾覆的海難船沒有下沉，而是順著洋流飄到了神盾艦演習的航線上，這可能嗎？ 一名軍官過來向艦長報告，艦上發現了笹浦海尉的斷臂，卡在艦船的注排水濾網上。
藤井七海和艦長聽了都大吃一驚。
笹浦洋介已死，還在艦上發現了斷臂，難道間諜X 已經潛入軍艦了？ 隔得太遠，柯南不知道發生了什麼事情，但從美女自衛官和艦長的表情來看，應該是發生了大事情。
柯南準備好了一個偽裝成黑色扭扣的小竊聽器，待美女自衛官和艦長走過來，他便推了下小男孩，小男孩站不穩，正好撞在藤井七海的大腿上。
美女自衛官見小男孩撞在她大腿上，立刻停下了腳步。
「勇氣，你又暈船了嗎？」柯南「焦急」地俯下身去，正好用身體擋住了眾人的視線，將竊聽器粘在藤井七海的袖口上。
「嗯，我頭暈。
」小男孩看著柯南兇惡的眼神，點頭回答。
「我們到甲板去吧，大家都去看大炮了，我們也去。
真對不起，給你添麻煩了。
」柯南將小男孩抱起來，向美女自衛官表示歉意，帶著小男孩去了甲板。
有小男孩做掩護，藤井七海沒有懷疑柯南的舉動，和艦長一起去了擺放笹浦海尉斷臂的艙室。
前來觀摩演習的名偵探毛利小五郎受邀去那裡查看斷臂。
初部推斷，笹浦洋介的斷臂是死後被吸入注排水裝置時卡斷的，具體情況還要送到警視廳去檢查。
艦長怕引起民眾恐慌，不想動用直升機送斷臂去警視廳。
毛利小五郎身邊一個小學生突然說他好像看直升機起飛的樣子，眾人便想到用演習的名義讓直升機起飛。
待眾人散去，藤井七海對艦長說道：「立石艦長，據我們之前的調查，笹浦洋介跟一個叫竹川的中國人有交往，我們已經取得了竹川的影像，如果竹川就是X 的話，說不定他已經取得了神盾艦的機密資料離開，所以才殺了笹浦洋介滅口。
」「如果資料外泄，將對我國國防產生重大危害。
藤井一佐，請你立刻聯繫防衛廳，全面抓捕竹川。
」柯南站在甲板上裝著聽音樂，實際上在聽藤井七海和艦長的談話。
讓他沒想到的是，笹浦洋介已死，竹川也暴露了。
不過對柯南來說，現在的情況反而對他有利，只要藤井七海和艦長懷疑竹川是X ，他才更安全。
現在最重要的是不能讓防衛廳抓到竹川。
「叔叔，你是勇氣的爸爸嗎，剛才船晃動的時候你沒和勇氣在一起。
」一個小學生站在小男孩身邊問柯南。
柯南看了小男生一眼，發現這個日本小學生和他小時候有幾分相似，大概上小學三四年級了，戴著一副眼鏡的樣子看起來很有智慧。
「那時候我去廁所了，所以沒和勇氣在一起，勇氣，我們去那邊的炮台拍照吧。
小朋友，再見。
」柯南對著小男生笑了笑，拉著小男孩去炮台那邊拍照，又帶著小男孩轉到了廁所里，讓小男孩呆在廁所隔間別走，他去聯繫竹川。
一架直升機停在了甲板上，從機上下來幾人，警視廳的目暮警部和佐藤美和子、高木涉兩位警官，還有兩位地方海保人員，發現可疑船隻的倉田和他的上司。
四人和立石艦長見面之後就到了控制室去討論案情。
笹浦洋介的屍體在船廠附近被發現，經判定是入海死亡后被遊船帶到船廠附近，再被海浪衝上岸的。
再加上神盾艦上發現笹浦洋介的斷臂，神盾艦極有可能是案發第一現場，所以警視廳派了目暮帶人上艦調查。
雖然笹浦洋介已經死亡很長時間，穗高號也從基地駛到了演習海域，立石艦長還是帶著眾人在艦上展開搜查。
藤井七海在導彈發射井旁的甲板上發現了笹浦洋介的手機。
正當藤井七海要仔細查看的時候，高木等人也到了那邊，匆忙間，藤井七海拔下了手機記憶卡，將手機留在了發射井蓋上。
記住地阯發布頁 發郵件到 diyibanzhu@記住地阯發布頁 發郵件到 第一版主（全拼）@記住地阯發布頁 發郵件到 DìYīBǎnZHǔ @ ＧＭＡＩＬ．ＣＯＭ藤井七海趁著眾人被笹浦洋介的手機吸引，獨自一人去艦長室，長現艦長室的密碼門鎖被破壞了。
美女自衛官感覺不妙，掏出手槍悄悄進了艦長室。
對整件事情好奇，又懷疑美女自衛官身份的工藤新一尾隨藤井七海進了艦長室，發現美女自衛官查看艦長的電腦，並將記憶卡插在了電腦上。
工藤新一用變聲揚聲器引開了美女自衛官，拷貝了美女自衛官查看的內容，發現是有關神盾艦的資料。
藤井七海在走廊處碰到艦長，知道自己受騙，立刻持槍衝進了艦長室，在翻滾的時候，沾在美女自衛官袖口上的竊聽器掉在了地上，自女自衛官看到地上的竊聽器，確信X 就在船上，而且還進入過艦長室。
工藤新一被美女自衛官堵在了艦長室，用衛星電波引來眾人。
得知美女自衛官及是直屬於防衛大臣的情報保全官員，負責自衛隊的情報管理，監視自衛隊軍官的動向，而死去的笹浦洋介是出賣神盾艦資料的間諜。
縮小的工藤新一對演習中出現的異常情況有懷疑，以找東西為借口，找出了笹浦洋介傳遞信號的信號旗。
讓眾人聯想到清晨時分，笹浦洋介是在山崖上揮舞信號旗傳遞信息。
藤井七海對工藤新一也產生了懷疑，跟著工藤新一到餐廳，問工藤新一到底是何方神聖。
工藤新一沒有回答美女自衛官，反問美女自衛官，有什麼機密數據是必須在艦上才能取得的，比如遇到潛艇突然攻擊才出現的數據。
「你是指為了得到這個數據，X 才安排了遇難船隻襲擊神盾艦嗎？」「這些數據要哪裡才能得到？」「CIC ，再有就是艦長室。
」藤井七海和工藤新一都想到了之前突發情況，艦長到了CIC ，艦長室空無一人，X 就是在那個時候潛入艦長室竊取情報的。